2021年5月，市政府办公室印发《南通市水环境区域补偿工作方案（2021年修订）》（通政办发〔2021〕29号），结合我市实际，对原有工作方案进行修订，新方案自2021年7月1日起正式施行。
一、修订背景
随着“十四五”国、省级水环境质量改善目标进一步提高，对水环境治理提出了更高要求。在总结“十三五”水环境区域生态补偿工作的基础上，为进一步倒逼和激励各地强化水环境整治，健全我市水生态保护补偿制度，加大补偿力度、完善补偿机制、提升长效机制，根据《省生态环境厅 省财政厅关于印发﹤江苏省水环境区域补偿工作方案（2020年修订）﹥的通知》（苏环办〔2021〕131号）内容，并结合我市实际情况，市生态环境局组织对工作方案进行修订。
二、修订思路
以强化各县（市）、区政府（管委会）水污染防治责任、切实改善水环境质量为目标，以“谁达标、谁受益，谁超标、谁补偿”为原则，实行“双向补偿”。当断面水质达标时，由下游地区对上游地区予以补偿；当水质超标时，由上游地区对下游地区予以补偿。
三、修订内容
（一）扩大补偿范围
本次修订在原有19条河流、36个补偿断面（含10个省级补偿断面）的基础上增加新江海河、丁堡河等21条河流，新江海河桥、李堡大桥等30个断面，累计66个补偿断面（含22个省级补偿断面）。全市所有行政区域均纳入生态补偿考核。
（二）紧扣考核断面
本次修订重点将“十四五”省考以上断面所在的重点河流纳入生态补偿考核范围。55个省考以上断面中，具备补偿条件的44个断面均纳入到生态补偿范围，目标均设为Ⅲ类。本次生态补偿范围基本覆盖各省级考核断面，进一步倒逼各地加强断面综合治理。
（三）提高补偿基数
浓度超标0.5倍以下（含0.5倍）的，月补偿基数由50万元提高至100万元；浓度超标0.5倍以上、1倍以下（含1倍）的，月补偿基数由75万元提高至150万元；浓度超标1倍以上的，月补偿基数由125万元提高至250万元。